テルローズさん、はじめまして。お母様の介護、お疲れさまです。
さて、ご質問の件ですが、障害者認定と介護保険とはどちらかを受けていると、どちらかを受けられないというものではありません。ですから、安心して介護認定を申請してください。
むしろ、障害者の認定を受けていることで、介護保険の自己負担額の減額処置がある場合などもあり、優遇される場合もあるのです。
介護保険の認定を受けたからと言って、障害者の認定に変更があるとか、障害者年金の支給額の減額などはくないはずです。ねんのため、地域包括センターで詳細をご確認の上、必要なら介護保険の利用の申請をなさるとよいと思います。
お母様の退院後の生活が少しでもスムーズにいくこと、お祈りしています。